Im Sinfonieorchester der Universität Mozarteum – einem Herzstück der Ausbildung – sammelten viele Orchestermusiker während ihrer Studienzeit unter der Leitung namhafter Dirigenten erste Podiumserfahrung und erhielten wesentliche Impulse für ihre künstlerische Entwicklung. Am Pult standen Persönlichkeiten wie Bernhard Paumgartner, Nikolaus Harnoncourt, Michael Gielen, Dennis Russell Davies, Peter Schneider, Gerd Albrecht, André Previn und Cornelius Meister. Von 2013 bis Herbst 2015 leitete Hans Graf das Sinfonieorchester und seit Oktober 2015 stehen Bruno Weil, Reinhard Goebel und Johannes Kalitzke dem Orchester vor und zeichnen außerdem für die Ausbildung der Dirigierstudenten verantwortlich.
